DNALinux Uma solução Linux para Bioinformática

Uma solução Linux para Bioinformática

DNALinux é uma máquina virtual com software bioinformático pré-instalado.
NOVO: Python de Bioinformática (Py4Bio) edição. Ir para página de download .

DNALinux VD: Py4Bio edição

DNALinux Virtual Desktop Py4Bio está pronto !. Esta edição é chamado Py4Bio porque é a distribuição Linux incluído no livro Python para Bioinformática .

Tela1Programas comuns de desktop usados em Bioinformática estão incluídos no DNALinux.Usando VMWare você pode executar programas Linux e Windows lado a lado.

Screen2DNALinux também é um servidor web. Você não tem que configurar um servidor web Apache e instalar programas CGI desde DNALinux tem-los pré-instalado e pronto para ser executado. Com um servidor, você pode fazer um BLAST a partir do seu computador host.

O que é DNALinux Virtual Desktop (VD)?

DNALinux VD é uma máquina virtual pré-configurada (VM) com aplicações direcionadas à bioinformática (análise de DNA e proteína). Esta máquina virtual é executado no topo da livre VMWare Player . Esse player pode ser executado em máquinas Windows e, como a máquina virtual funciona dentro do player, tudo o que você faz com DNALinux VD não toca no computador host para que você possa ter dois ambiente de trabalho separado (DNALinux e Windows juntos no mesmo computador).

Que software está disponível no DNALinux?

Além dos programas habituais do Linux, o software Bioinformatics está incluído, como: ApE-A Plasmid Editor, Biopython, Blast, Emboss, FinchTV, NCBI Toolkit, Polyxmass, primer3 (e uma interface web, primer3plus), Rasmol, Readseq e muitos mais . Veja aqui a lista completa .

Requisitos

Hardware

  • CPU Pentium IV ou melhor
  • 1 Gb de RAM
  • 20 GB de espaço em disco

Programas

Citando DNALinux

Use esta referência:

Bassi, Sebastian e Gonzalez, Virgínia. DNALinux Virtual Desktop Edition. Disponível em Nature Precedings <http://dx.doi.org/10.1038/npre.2007.670.1&gt; (2007)

Para citar um pacote em particular (como grave, BLAST, biopython), vê no software instalado página.

Install instructions

  1. Download the torrent file.
  2. Download DNALinux using the torrent with a bittorrent compatible program like “Bittorrent”, Bittorrnado, Vuze (see here for a complete list)
  3. Download VMWare Free Player
  4. Download 7zip uncompressor
  5. Uncompress DNALinux.7z using 7zip and play the vmk file with VMWare Player.

Direct download in RapidShare (12 parts):

Instruction for files downloaded from Rapidshare:

To join the parts in Windows:

copy /b dbasea* dnalinux.7z

To join the parts in Linux:

cat dbasea* > dnalinux.7z

MD5 checksum: f75e88f48e08161be62b70a8ef465e17

Anúncios